20藍普爾其市，巨大毒刺水母。
得到了收服巨大毒刺水母所必備的超重球之後，小羽就對手上的神奇寶貝們進行了特訓。
很快時間來到了第二天，小羽和小雅由於沒有鬧鬧鐘的關係錯過了通信船，當然小智三人組也是一樣。[.]
正當小羽和小雅準備離開碼頭時，突然前方發生了爆炸，小智他們都派出了神奇寶貝前去救人，小羽和小雅自然也不甘落後。
在救下了人之後，小羽和小智等人就受到了銀婆婆的召見，銀婆婆要求他們用神奇寶貝趕走瑪瑙水母，但被小霞拒絕了。
不過這麼做不代表銀婆婆就會放棄，接著銀婆婆就在廣播中喊出一百萬召集勇士來打倒水母，頓時一大群人以極快的速度來到了碼頭上，這場面比電視里放的壯觀多了，這頓時讓小羽明白無論在哪個世界，貪財的人永遠都是這麼多。
接下來火箭隊再次登場，並且率先出海，用他們所謂的「國產三杯醋」製造出了那隻變異的巨大毒刺水母。
緊接著人類部隊就和水母部隊展開了交戰，不過這場戰鬥就是一面倒啊，人類部隊被巨大毒刺水母領銜的水母大軍打得是節節敗退，而銀婆婆那花了巨資所建造的海上飯店和遊樂園等設施都被巨大毒刺水母破壞的一團糟。
「喂，毒刺水母，等一下好不好？」小羽實在是看不下去城市被這樣破壞，道：「和我來一場神奇寶貝對戰吧，如果我贏了的話就做我的夥伴吧，如果我輸了的話我就不再插手你們與這座城市的恩怨不知道這樣行不行啊？」
聽到小羽的話毒刺水母點了點頭，或許在它看來現在的自己也只有那些神獸才能與自己較量吧。
「好，去吧，口呆花，比雕，寶石海星，火爆猴。」小羽一見毒刺水母同意馬上就派出了四隻神奇寶貝。
「小羽，這太危險了，對手的體型太大了。」小雅站在一旁擔心道。
「放心，巨大快龍我都贏了，更何況是毒刺水母。」小羽自通道：「你就看我的吧，小雅。」
「火爆猴，跳到比雕的身上。」小羽下令道：「比雕，你帶著火爆猴對毒刺水母行進正面襲擊，寶石海星，你用幻象術牽制住毒刺水母，最後口呆花，你使用陽光烈焰來攻擊毒刺水母。好了，一切都拜託各位了，上吧！」
得到命令的火爆猴一躍跳到了比雕的身上，接著比雕帶著火爆猴快速的靠近著巨大毒刺水母，雖然巨大毒刺水母用它的觸手試圖阻止比雕和火爆猴，但是比雕的速度可不是蓋的，再加上有寶石海星的幻象術牽制著巨大毒刺水母，使得比雕和火爆猴順利的來到了巨大毒刺水母身邊。
「就是這樣火爆猴。」小羽喊道：「跳到毒刺水母的身上使用連續的閃電拳，比雕使用燕返攻擊，口呆花陽光烈焰準備好了吧，發射吧！」
得到命令的火爆猴跳到了毒刺水母的身上，接著舉起雙拳使出了閃電拳狠狠地打在了毒刺水母的身上，頓時給毒刺水母帶來了不小的傷害。接著比雕的燕返和口呆花的陽光烈焰也紛紛命中毒刺水母，又給毒刺水母造成了傷害。
吃了虧的毒刺水母馬上就展開了反擊，首先它的目標是火爆猴，只見毒刺水母伸出了無數的觸手想要纏住火爆猴，但是被寶石海星的幻象術控制，無奈之下毒刺水母的注意力也轉移到了寶石海星身上，只見毒刺水母的寶石上發出了一道黃色的光線以極快的速度襲向了寶石海星。
「不好，快避開來啊，寶石海星。」小羽急忙叫道。巨大毒刺水母的破壞死光可不是現在的寶石海星可以硬抗的。
得到命令的寶石海星迅速躲開了破壞死光，而站在毒刺水母背上的火爆猴馬上又是兩擊閃電拳打在了毒刺水母的身上，但是毒刺水母這一次是鐵了心要打倒寶石海星了，並沒有去管火爆猴，而是伸出了無數的觸手襲向了寶石海星，雖然寶石海星控制住了一部分觸手但還是被毒刺水母其餘的觸手給纏住了。
「比雕，快去協助寶石海星。」小羽馬上命令道。
得到命令的比雕馬上一個迴旋想要去解救寶石海星，但是卻被毒刺水母的破壞死光阻擋，而口呆花雖有心去幫忙，可是這體型實在是差太大了，巨大毒刺水母的幾條觸手就直接擋下了口呆花的攻擊，讓口呆花無功而返。
接下來毒刺水母對寶石海星使出了破壞死光，由於寶石海星被纏繞著的關係，只得眼睜睜看著自己被破壞死光打中，失去了戰鬥能力。
「回來吧寶石海星。」小羽收回了寶石海星，「接下來看各位的了，比雕掩護火爆猴，火爆猴使用連續的閃電拳，口呆花使用破壞死光。」
得到命令的火爆猴對著毒刺水母不斷的使用著閃電拳，而毒刺水母想要用觸手纏住火爆猴是，比雕總會用電光一閃等技能來干擾毒刺水母，緊接著口呆花也使出了破壞死光打在了毒刺水母的身上，又給毒刺水母帶來了傷害。
「接下來就是最後一擊了！」小羽喊道：「比雕，口呆花，火爆猴，使用破壞死光結束對手吧。」
得到命令的三隻神奇寶貝紛紛使出了破壞死光，首先是火爆猴的破壞死光命中毒刺水母，而這也充分激怒了毒刺水母，毒刺水母馬上伸出了觸手纏住了火爆猴，正當它準備進一步攻擊火爆猴時，比雕和口呆花的攻擊也紛紛命中，頓時毒刺水母的臉上露出了痛苦的表情。
「好，去吧，超重球。」小羽在毒刺水母路出痛苦之色的瞬加丟出了超重球。
超重球砸到了巨大毒刺水母的身上，發出一陣巨大的紅光將巨大毒刺水母給吸收了進去，接著超重球開始不斷的閃了起來，而在場所有人的眼睛也目不轉睛地看著超重球，到底能不能成功收服這個已經算得上是怪物的巨大毒刺水母呢？
超重球不斷的閃爍著，終於在小羽和大家期待的眼神中巨大毒刺水母停止了掙扎，收服成功了！
「太好了！」小羽從比雕的手中接過超重球之後興奮地喊道，接著巨大毒刺水母就被傳了回去。
畫面來到大木研究所，此時的大木博士正在研究著剛剛正輝博士傳給他的巨大快龍，突然傳送機上閃過了一陣電火花，接著又是一個超重球被傳了過來，而傳送者正是剛剛收服巨大毒刺水母的小羽。
「小羽這孩子居然在正輝燈塔那裡收服到了這麼大的快龍，還真是讓我感到吃驚啊！」大木博士說著又拿起了小羽剛剛傳送過來的超重球，道：「好了，就讓我來看看這小子這次用這個超重球又收服了什麼神奇寶貝，該不會又是什麼巨大神奇寶貝吧。」
「什麼！居然有這麼大個兒的毒刺水母，這小子還真是厲害啊》」大木博士看完超重球中的資料后道：「不過更讓我想不到的是世界上居然有除了巨大快龍以外還這麼大的非神獸的神奇寶貝，而且居然還都讓這小子收服了，看來這一次我的孫子小茂是比不上他了啊。」
畫面回到藍普爾奇，收服了巨大毒刺水母之後的小羽心想只剩下瑪瑙水母的水母部隊應該不會有什麼太大的問題了，就退出了戰鬥。
可是這瑪瑙水母雖然沒了毒刺水母這個巨大的支柱，但還是打贏了人類部隊。接著就在城市再度遭遇滅頂之災時，小霞站了出來說了一堆催人淚下的話感動了水母大軍。不過銀婆婆就是死性不改，又拿著大炮攻擊水母，接著就被水母打飛，成為了天上的星星。
接著解決了水母事件之後，久違的通信船終於來了。小羽小雅以及小智三人組都上了同一條船，在船上小剛和小雅討論著神奇寶貝食物的問題，小霞則不斷的拿小羽和小智作比較，弄得小智是大吼大叫啊。而小羽則一個人在船上吹著海風。
「想見你，我好想見你。」突然小羽的耳邊傳來了這樣的一個聲音，這頓時把小羽給嚇了一跳，不過一想到快要到少女峽了的時候，小羽也就釋然了，就是不知道說這句話的到底是那隻會說人話的鬼斯還是那個少女的靈魂了。
第二天上午，船來到了少女峽，而這裡正好在舉辦廟會，小羽就帶著小雅好好地逛了一下廟會，難得的輕鬆了一把。
對於少女峽的鬼斯，小羽自己也不知道到底是收服它還是不收服它，這隻鬼斯給小羽的印象是相當的好，因為它雖然在世界的各個地方旅行，而且有時候還會捉弄一下別人，但是它卻不斷的幫助著那些需要幫助的人和幽靈，這麼一來小羽也就不好意思收服它了。
但是不收服這隻鬼斯的話，黃金市的娜姿小羽根本就沒有辦法與之抗衡，因此這讓小羽感到很為難。
「太像了，你實在是太像了！」這時一個聲音從些小羽背後響了起來，這頓時讓小羽嚇了一跳，回頭一看發現說話的是一個老太婆。
「這個，老人家，請問您剛剛說的話是什麼意思啊？」小雅好奇地問道：「小羽他很像誰啊？」
「原來你叫小羽啊，聽好了，你很像那個少女的情人啊，所以自己小心吧。」老太婆說完這句話后就走開了。