一 過去、現在、未來
十五年後。
列車站台上顯得格外得擁擠，耳邊全是家長們與孩子們的道別聲。許許多多的孩子湧上一輛與眾不同的列車——它通體漆黑，拉上的暗紅色窗帘阻隔了所有人的視線。
那些拎著各色行李箱的男孩女孩們與父母依依分別後就怯怯地上了車。當他們掀開那暗紅色的帘子后，就被車內的豪華布置驚到了。
黑漆的木質牆把列車分割成許多寬敞的隔間。所有隔間左側，車門右側有一條走廊。走廊在每個隔間門口都設有一個蓮花狀的水晶吊燈，明亮的燈光映亮了整個車箱。
透過玻璃門可以看到裡面兩個皮質米白色軟沙發，和中間擺放著的與隔牆同樣材質和顏色的方桌。米白色沙發上方有兩排柜子，一排柜子是空的，給人們放行李；另一排柜子里有天鵝絨毯子和羊毛氈。
這輛列車的終點站是一所學院。
一百多年前，【生化研究所】的所長卡列夫研究出了一種名為【凈化生命】的藥劑。這種藥劑的作用是改變生命體DNA。經過活體實驗后發現，這種藥劑會大幅提高注射者的某種能力甚至可以增加註射者大多數同物種沒有的技能。藥劑的效果會隨著配方的改變而略有不同。
「凈化生命」在市場上被大肆銷售一空。越來越多的人注射了這種藥劑，但各種偽造品也越來越多。注射了偽造品的人或動物產生了變異。
隨著變異生命體越來越多，各大政府聯合成立了【拯救】組織。組織成員全部由注射了正品「凈化生命」的人組成，他們被稱為【生命特工】。
生命特工們將所有變異后的異端聚集在拯救總部南北兩個城市中，這兩個城市被稱為【異端之都】。在異端動亂平息之後，研究出「凈化生命」的卡列夫院長家中起了一場大火，所有關於「凈化生命」的資料都被燒毀，院長庫存「凈化生命」被洗劫一空，院長一家人也在火災中死亡。
之後一個名叫【黑貓】的組織橫空出世，號稱他們拿走了卡列夫院長的所有「凈化生命」。拯救再次出動捕獲黑貓成員，奪回「凈化生命」。但這次，拯救卻無功而返。黑貓的人數雖不及拯救，但他們過於狡猾，行蹤令人無注捉摸。
雪上加霜的是，生命特工們相繼衰老，死去。
研究過後，生化研究所發現，注射「凈化生命」后所產生的能力並不能被遺傳，但偽造的「凈化生命」所創造的異端是可繁衍的。但在半個世紀的努力下，他們終於研究出了再創生命特工的方法。研究員們將老生命特工的DNA提取出來，再將其植入與之匹配的生命體中后，該生命體也會擁有老特工的能力。這項技術被稱為【再次凈化】。老特工的DNA被稱為他們的【靈魂核心】。
雖然政府對這項技術嚴格控制，也限至了生命特工的人數。但還是有人將這項技術泄露給了遇到同樣問題的黑貓。
今天，「再次凈化」技術掌握在靈魂核心研究學院手中，而那些坐著漆黑的特快列車的孩子們，就是靈魂核心研究學院新生。未來，他們中的一部分也會成為生命特工。
也許，這輛列車上還坐著一位傳奇。
「M42618號特快列車馬上就要出發了，請還沒有上車的乘客抓緊時間上車。」
「啊——總算是要出發了!」某節車廂中傳來一個男生大大的哈欠聲。
「是啊，再不出發都要過年了。」模樣似他弟弟的男孩應他道。
隔間中的又一人說道：「你們倆急什麼」
少年斜倚在皮沙發的靠背與扶手的交界處，皺著眉，擰著一個魔方，道:「無聊啊！」說著，他又打了一個哈欠。
應他的那個少年搶過他手中的魔方，動作嫻熟而快速地擰了起來，卡卡嗒嗒聲不絕於耳。
最後一個說話的男生從自己正在看的書上抬起眼睛，望著懶懶斜倚在沙發上的少年說道:「你可以多看看書，這樣就不會覺得無聊了。」
這三個男孩是三兄弟，老大叫劉奇，正斜倚在沙發上打著哈欠；老二叫劉榮，推了推眼鏡，又把目光移到了書上；老三叫劉遠，正將魔方的最後幾塊復原。
劉遠曾拿劉榮的名字打趣，問過父親:「『榮』和『葩』都是花的意思，為什麼要叫『劉榮』，不叫『劉葩』」父親當場拍著劉榮的肩，一邊叫著「劉葩」一邊笑，差點笑斷了氣兒。
劉奇伸了一個懶腰：「天天瞪著你們兩個男的很沒趣啊，要是包廂里可以多兩個卡哇伊的女孩子就好了。」
劉遠隨手將魔方扔給劉奇：「那你更該去看書了，畢竟『書中自有顏如玉』。」
劉榮臉色一沉，劉奇卻咯咯地笑了起來。
劉榮道：「劉遠，你快被劉奇帶壞了。」
劉奇看了看弟弟，做了一個怪我嘍的表情。
這時，敲門聲響了起來，三兄弟同時把目光投向門外。門外站著一個姑娘，齊腰的黑髮，水汪汪的大眼睛，高鼻樑，粉嫩的嘴唇，尖尖的下巴。她穿著白色的襯衫和一條花格子短裙，腳上一雙三分跟小皮鞋。
劉奇一見到這姑娘就立刻推了推自己身邊的劉遠;劉遠白了他一眼，拍著離門最近的劉榮;劉榮優雅的起身把書放在桌上，走到門邊，推開了門，問:「您好，請問——」
女孩打斷了他，「您好，你，你們這裡還有空位子嗎我找不到位子。能不能……」女孩的聲音越來越小。
「當然。」劉榮優雅地回答，並為姑娘推門。
「謝，謝謝!」
姑娘明顯有些緊張，畢竟她是房間中唯一個女生。
男孩子們似乎都打起來精神，目光是不是便在蘇晴雨精緻的臉蛋上流轉。
劉奇臉上掛起了一個友善的笑容，微微眯眼，望著面的姑娘問:「你叫什麼名字啊」
姑娘被他看得有些臉紅:「我叫蘇晴雨，你呢」
「劉奇。」
「哦…啊！你就是劉奇！」
「嗯…」劉奇有些驚訝，「我們，認識」
「哦，不認識，不認識。」蘇晴雨忙回道。說完后，她就拿出手機，發起消息來。
女孩心裡波濤洶湧，自己就想找個空位子，怎麼偏偏撞上了劉奇呢？不出意外，那兩個少年就是他的弟弟了吧。老師說要和院長保持距離，自己呢？一上車就坐到了院長三個兒子對面了。